ＧＧＧバリアリーフのエリアⅤを構成する諜報部所属の巨大潜水艦。ベイタワー基地メインコンピューターから完全に独立したコンピューターシステム多次元コンピューターを備え、情報収集と隠密性能に優れるほか、水中ミサイルを装備｡６基の機動要塞のうち、唯一戦闘能力を有している。実際激化する機界文明の攻勢に対抗するため、獅子王凱機動隊長とボルフォッグが兵装の強化を検討した要塞でもある｡結局予算的な都合や､改装による長期間の艦の拘束が予測されたため､兵装強化は見送られる形になったが､この時の教訓を活かして百式司令部多次元艦には厳重な兵装が施されることとなった。
また艦先端部には先行偵察兼緊急脱出用ジェット飛行機フライ１、艦体中央部には特殊潜航艇マリン１が搭載されている。フライ１は緊急時に乗員と多次元コンピュータを脱出させ、可能な限り情報を帰還させるためのサバイバリティの追求の結果であり、一方マリン１は深海での調査偵察作業を目的としている。艦橋にはボルフォッグが常駐しており、各種センサーによる偵察､索敵と多次元コンピューターによる戦況分析を主任務としている。ちなみにボルフォッグのＡＩによる遠隔操作も可能である。
ゾンダリアン最終作戦に伴うＥＩ－２７との戦闘において、ボルフォッグの遠隔操作によりＥＩ－２７に特攻を敢行。機界文明の機械類吸収能力を逆手にとって自爆し、ＥＩ－２７の撃破に成功するが、その後の機界３１原種の襲来によって、オービットベース及び各ディビジョンフリートが本格的に稼動を開始し、そのため再び建造されることはなかった。
分類 Ａｍｐｈｉｂｉｏｕｓ
Ｓｕｂｍａｒｉｎｅ
型式 Ｃ３Ｉ（指揮管制・通信情報システム）
満載排水量 ７８０００ｔ
全長 ２３０ｍ（非展開時）
全高 １１０ｍ（非展開時）
外殻構造 チタン合金モノコック構造
制御解析用コンピューター 多次元コンピューター
潜航限界深度 ３０００ｍ
主動力 多次元エンジン
航行速度 ３８ｋｔ
緊急時最大航行速度 ４２ｋｔ
管理責任者 猿頭寺耕助
備考
猿頭寺チーフオペレーターの特別ＩＤとパスワードによって遠隔操作が可能。またボルフォッグのＡＩによっても遠隔操作が可能となっている。