全て挙げるとかなりの量なので、主なものを掲載。
ミツルギ
でも私は、きみたちには
助けてほしくないんだ！
DS版：
ミツルギ
ヤハリ
ふううん。
‥‥いい話だなあ。
DS版：
ヤハリ
カルマ
目撃者は、2人いたのだ。
ナルホド
（げっ！）
カルマ
2人の話は、ほぼ
同じ内容だったのでね。
DS版：
カルマ
カルマ
‥‥裁判長。おねがいする。
DS版：
カルマ
マヨイ
御剣さんを見たかどうかも
ハッキリしないし‥‥。
DS版：
マヨイ
ナルホド
なあ。
なんであんなこと
したんだよ。
DS版：
ナルホド
ナルホド
零時ちょっと前に、矢張が
聞いたのは、その銃声です！
DS版：
ナルホド
ミツルギ
成歩堂の言ったことは、
だいたいにおいて正しい。
DS版：
ミツルギ
ナルホド
ス‥‥スタンガンだよ。
護身用の武器だ。
DS版：
ナルホド
イトノコ
うう‥‥なんてこった‥‥！
DS版：
イトノコ
ナルホド
惜しかったな。
‥‥あと、もう１日だったのに。
DS版：
ナルホド２日目・探偵（第二回探偵）、ボート小屋にて、話す「ソバ屋」中のセリフ、
マヨイ
板前‥‥って、
おスシ屋さんじゃなかったっけ？
オヤジ
メグミ！
DS版
マヨイ
オヤジ（灰根）のセリフの「！」（エクスクラメーションマーク）が抜けている。
書籍「逆転裁判 蘇る逆転 脚本大全」にも同じ誤字が掲載されている。
また、この誤字はスマートフォンアプリ以降の移植作品でも未修正のままである。