滅亡する地球から最後の人類を載せて脱出した避難船ギルガメシュ、計画が妨害された後脱出船の中でコールドスリープに入り緑の惑星を周回し見守るいわば緑の星の創造主カーン、進化し続ける地上の蜘蛛の三者の視点で話が繰り広げられる。人類はコールドスリープを繰り返し二千五百年生き続け進化しないが、蜘蛛は世代交代をしている。