| 路線名 | 行き先 | 土浦駅 発車時刻 | 接続駅と発車時刻 | 備考 | |
| 水戸線 | 小山 | 21:02 | 友部21:40 | ||
| 水戸線 | 下館 | 22:06 | 友部22:48 | ||
| 水郡線 | 常陸大子 | 21:38 | 水戸22:30 | ||
| 水郡線 | 常陸大宮 | 22:06 | 水戸23:17 | ||
| 水郡線 | 常陸太田 | 21:38 | 水戸22:30→上菅谷22:48 |
| 路線名 | 行き先 | 土浦駅 発車時刻 | 接続駅と発車時刻 | 備考 | |
| 成田線 | 成田 | 22:43 | 我孫子23:54 | 我孫子行き最終では間に合いません。 | |
| 宇都宮線 | 宇都宮 | 21:44 | 上野23:14 | ||
| 宇都宮線 | 小金井 | 22:19 | 上野23:38 | ||
| 高崎線 | 高崎 | 22:19 | 上野23:25 | この後籠原行きがあります。 | |
| 埼京線 | 川越 | 22:19 | 日暮里(山手線)23:38→池袋23:52 | この後大宮行き、赤羽行きがあります。 | |
| 武蔵野線 | 新習志野 | 22:43 | 柏(常磐線各駅停車)23:26→新松戸23:33 | この後数本あります。 我孫子行き最終では間に合いません。 | |
| 武蔵野線 | 府中本町(平日) | 22:04 | 柏(常磐線各駅停車)22:55→新松戸23:08 | ||
| 武蔵野線 | 府中本町(休日) | 22:04 | 柏(常磐線各駅停車)22:56→新松戸23:08 | ||
| 武蔵野線 | 東所沢 | 22:43 | 柏(常磐線各駅停車)23:26→新松戸23:41 | この後数本あります。 我孫子行き最終では間に合いません。 | |
| 中央線 | 高尾(平日) | 22:19 | 上野(山手線)23:31→東京23:45 | ||
| 中央線 | 高尾(休日) | 22:19 | 上野(山手線)23:31→東京23:46 | ||
| 青梅線 | 青梅(平日) | 22:04 | 上野(京浜東北線)23:20→神田23:29 | 東京駅乗り換えでは間に合いません。 | |
| 青梅線 | 青梅(休日) | 22:04 | 上野(京浜東北線)23:20→神田23:32 | 東京駅乗り換えでも一応間に合います。 | |
| 中央線 | 武蔵小金井(平日) | 22:43 | 上野(京浜東北線)23:56→神田0:07 | 必ず京浜東北線を利用しかつ神田で乗り換えて下さい。(山手線利用不可、東京乗換不可) | |
| 中央線 | 武蔵小金井(休日) | 22:43 | 上野(京浜東北線)23:56→神田0:08 | 必ず京浜東北線を利用しかつ神田で乗り換えて下さい。(山手線利用不可、東京乗換不可) | |
| 総武線 | 三鷹 | 22:43 | 上野(山手線)23:59→秋葉原0:09 | この後1本三鷹行き最終電車があります。さらに中野行きは2本あります。 | |
| 総武線 | 千葉 | 22:43 | 上野(山手線)23:59→秋葉原0:08 | この後津田沼行きが2本あります。 | |
| 総武快速線 | 佐倉(平日) | 21:18 | 東京22:57 | 東京駅の乗り換え時間は約20分で計算しています。 佐倉で成東行き最終に乗れます。 千葉で茂原行き(外房線)君津行き(内房線)に乗れます。 | |
| 総武快速線 | 佐倉(休日) | 21:18 | 東京22:54 | 東京駅の乗り換え時間は約20分で計算しています。 佐倉で成東行き最終に乗れます。 千葉で茂原行き(外房線)君津行き(内房線)に乗れます。 | |
| 京葉線 | 蘇我 | 22:19 | 上野(山手線)23:38→東京0:06 | 東京駅の乗り換え時間は約20分で計算しています。 | |
| 東海道線 | 小田原 | 22:04 | 上野(山手線)23:09→東京23:39 | ||
| 東海道線 | 国府津 | 22:19 | 上野(山手線)23:31→東京23:47 | この後平塚行きがあります。 | |
| 横須賀線 | 久里浜 | 21:18 | 東京23:04 | 東京駅の乗り換え時間は約20分で計算しています。 | |
| 横須賀線 | 逗子 | 21:44 | 上野(山手線)23:07→東京23:35 | 東京駅の乗り換え時間は約20分で計算しています。 | |
| 横須賀線 | 大船 | 22:04 | 上野(山手線)23:25→東京23:50 | 東京駅の乗り換え時間は約20分で計算しています。 | |
| 京浜東北線 | 大宮 | 22:43 | 上野23:56 | この後数本あります。 快速接続のある我孫子行きでは間に合いません。 | |
| 京浜東北線 | 大船 | 22:19 | 上野23:32 | 上野行き最終では磯子、桜木町行き最終には間に合いません。 | |
| 京浜東北線 | 蒲田 | 22:43 | 上野23:56 | この後数本あります。 | |
| 山手線(池袋方面) | 大崎 | 22:43 | 上野23:55 | この後数本あります。 | |
| 山手線(池袋方面) | 池袋(平日) | 23:25 | 我孫子(常磐線快速)0:02→上野0:46 | ||
| 山手線(池袋方面) | 池袋(休日) | 23:25 | 我孫子(常磐線快速)0:02→上野0:47 | ||
| 山手線(品川方面) | 池袋 | 22:43 | 上野23:59 | ||
| 山手線(品川方面) | 品川 | 23:25 | 我孫子(常磐線快速)0:02→上野0:39 |
| 路線名 | 行き先 | 土浦駅 発車時刻 | 接続駅と発車時刻 | 備考 | |
| 東北新幹線 | 仙台 | 20:12 | 上野21:50 | やまびこ223号 | |
| 東北新幹線 | 那須塩原 | 21:18 | 上野22:50 | なすの281号 | |
| 上越新幹線 | 新潟 | 20:58 | 上野21:26 | とき347号 | |
| 上越新幹線 | 越後湯沢 | 20:58 | 上野22:34 | たにがわ417号 | |
| 北陸新幹線 | 長野 | 20:37 | 上野22:14 | あさま633号 | |
| 東海道新幹線 | 名古屋 | 20:37 | 上野(山手線)21:50→東京22:03 | ひかり669号 | |
| 東海道新幹線 | 静岡 | 20:37 | 上野(山手線)21:50→東京22:12 | こだま813号 | |
| 東海道新幹線 | 三島 | 21:18 | 東京22:48 | こだま815号 |
| 路線名 | 行き先 | 土浦駅 発車時刻 | 接続駅と発車時刻 | 備考 | |
| ひたちなか海浜鉄道湊線 | 阿字ヶ浦 | 22:06 | 勝田23:23 | ||
| 大洗鹿島線 | 新鉾田 | 21:02 | 水戸22:15 | ||
| 大洗鹿島線 | 大洗 | 22:06 | 水戸23:21 | ||
| 関東鉄道竜ケ崎線 | 竜ケ崎 | 22:43 | 龍ヶ崎市(佐貫)23:25 | ||
| 関東鉄道常総線 | 守谷→下妻(休日) | 22:04 | 取手22:55 | 守谷で下妻行きに接続 | |
| 関東鉄道常総線 | 水海道→下妻(平日) | 22:04 | 取手22:58 | 水海道で下妻行きに接続 | |
| 関東鉄道常総線 | 水海道 | 23:25 | 取手23:54 | ||
| 東武アーバンパークライン | 船橋 | 23:25 | 我孫子(常磐線快速)0:02→柏0:07 | この後1本あります。 | |
| 東武アーバンパークライン | 大宮 | 22:19 | 柏23:08 | ||
| 東武アーバンパークライン | 春日部 | 22:43 | 柏23:30 | ||
| 東武アーバンパークライン | 七光台 | 23:25 | 我孫子(常磐線快速)0:02→柏0:16 | ||
| 流鉄流山線 | 流山 | 22:43 | 柏(常磐線各駅停車)23:39→馬橋0:07 | ||
| 京成松戸線 | 京成津田沼 | 22:43 | 松戸23:44 | ||
| 京成松戸線 | くぬぎ山 | 23:25 | 我孫子(常磐線快速)0:02→松戸0:23 | ||
| 京成金町線 | 京成高砂 | 22:43 | 松戸(常磐線各駅停車)23:41→京成金町23:56 | ||
| 北総線(京成金町線経由) | 印旛日本医大 | 22:43 | 松戸(常磐線各駅停車)23:41→京成金町23:56→京成高砂0:10 | ||
| 京成本線 | 京成成田(快速)(平日) | 21:44 | 日暮里22:47 | ||
| 京成本線 | 京成成田(快速)(休日) | 22:04 | 日暮里23:16 | ||
| 京成本線 | 京成佐倉(快速)(平日) | 22:19 | 日暮里23:44 | ||
| 京成本線 | 京成佐倉(快速)(休日) | 22:19 | 日暮里23:42 | ||
| 京成本線 | 千葉中央(京成津田沼乗換)(平日) | 22:04 | 日暮里23:14(普通京成成田行き)→京成津田沼0:04 | ||
| 京成本線 | 千葉中央(京成津田沼乗換)(休日) | 22:04 | 日暮里23:16(快速京成成田行き)→京成津田沼0:04 | ||
| 京成本線 | 京成津田沼(普通) | 22:43 | 日暮里23:56 | この後普通京成高砂行きがあります。 | |
| つくばエクスプレス | 守谷 | 22:43 | 北千住23:46 | 八潮、三郷方面用 この後つくば行きを含めて数本あります。 | |
| 東武スカイツリーライン | 館林(区間急行) | 22:19 | 北千住23:19 | 伊勢崎線方面 | |
| 東武スカイツリーライン | 南栗橋(急行) | 22:43 | 北千住0:03 | 日光線方面 | |
| 東武スカイツリーライン | 竹ノ塚(普通) | 23:25 | 我孫子(常磐線快速)0:02→北千住0:34 | ||
| 東武スカイツリーライン | 浅草(区間急行) | 22:43 | 北千住23:46 | 普通と変わりません。 | |
| 東武スカイツリーライン →東京メトロ半蔵門線→東急田園都市線 | 中央林間(平日) | 21:44 | 北千住23:01→長津田0:40 | ||
| 東武スカイツリーライン →東京メトロ半蔵門線→東急田園都市線 | 中央林間(休日) | 21:44 | 北千住23:01 | ||
| 東武スカイツリーライン →東京メトロ半蔵門線→東急田園都市線 | 長津田(平日) | 22:19 | 北千住23:26 | この後鷺沼行きがあります。 | |
| 東武スカイツリーライン →東京メトロ半蔵門線→東急田園都市線 | 長津田(休日) | 22:19 | 北千住23:25 | この後鷺沼行きがあります。 | |
| 東武スカイツリーライン | 押上(平日) | 22:43 | 北千住23:52 | ※平日のみ | |
| 東武亀戸線 | 亀戸(平日) | 22:43 | 北千住23:46→曳舟23:57 | この後1本あります。 | |
| 東武亀戸線 | 亀戸(休日) | 22:43 | 北千住23:46→曳舟23:56 | この後1本あります。 | |
| 東急東横線・みなとみらい線 (東京メトロ日比谷線中目黒乗換) | 元町・中華街(平日) | 21:44 | 北千住(東京メトロ日比谷線)22:59→中目黒23:49 | ||
| 東急東横線・みなとみらい線 (東京メトロ日比谷線中目黒乗換) | 元町・中華街(休日) | 21:44 | 北千住(東京メトロ日比谷線)23:00→中目黒23:49 | ||
| 東急東横線・みなとみらい線 (東京メトロ日比谷線中目黒乗換) | 横浜(平日) | 22:19 | 北千住(東京メトロ日比谷線)23:17→中目黒0:06 | この後数本あります。 (菊名、元住吉行きも同時刻です。) | |
| 東急東横線・みなとみらい線 (東京メトロ日比谷線中目黒乗換) | 横浜(休日) | 22:19 | 北千住(東京メトロ日比谷線)23:18→中目黒0:06 | この後数本あります。 (菊名、元住吉行きも同時刻です。) | |
| 東京メトロ日比谷線 | 中目黒 | 22:43 | 北千住23:52 | ||
| 小田急線 (東京メトロ千代田線代々木上原乗換) | 小田原 | 21:18 | 北千住22:44→代々木上原23:27 | ||
| 小田急線 (東京メトロ千代田線代々木上原乗換) | 海老名 | 23:25 | 我孫子(常磐線快速)0:02→北千住23:29(千代田線)→代々木上原0:06 | ||
| 小田急線 (東京メトロ千代田線代々木上原乗換) | 片瀬江ノ島 | 21:44 | 北千住22:54→代々木上原23:39(急行本厚木行き)→相模大野0:17 | ||
| 小田急線 (東京メトロ千代田線代々木上原乗換) | 唐木田 | 23:25 | 我孫子(常磐線快速)0:02→北千住23:29(千代田線)→代々木上原0:06(急行海老名行き)→新百合ヶ丘0:45 | ||
| 東武東上線 | 小川町(急行) | 21:18 | 日暮里(山手線)22:43→池袋23:02 | ||
| 東武東上線 | 森林公園(準急) | 22:19 | 日暮里(山手線)23:38→池袋0:02 | ||
| 東武東上線 | 川越市(準急) | 22:43 | 日暮里(山手線)0:11→池袋0:30 | この後普通成増行きがあります。 | |
| 西武池袋線 | 飯能(準急)(平日) | 22:19 | 日暮里(山手線)23:31→池袋23:52 | ||
| 西武池袋線 | 飯能(準急)(休日) | 22:04 | 日暮里(山手線)23:17→池袋23:40 | ||
| 西武池袋線 | 小手指(準急) | 22:43 | 日暮里(山手線)23:52→池袋0:14 | この後各停保谷行きがあります。 | |
| 西武新宿線 | 本川越(準急)(平日) | 22:19 | 日暮里(山手線)23:24→高田馬場23:46 | ||
| 西武新宿線 | 本川越(準急)(休日) | 21:44 | 日暮里(山手線)23:10→高田馬場23:35 | ||
| 西武新宿線 | 新所沢(準急) | 22:43 | 日暮里(山手線)23:52→高田馬場0:18 | この後各停上石神井行きがあります。 | |
| 西武新宿線 | 拝島(平日) | 22:19 | 日暮里(山手線)23:24→高田馬場23:46(準急本川越行き)→小平0:17 | ||
| 西武新宿線 | 拝島(休日) | 21:44 | 日暮里(山手線)23:10→高田馬場23:35(準急本川越行き)→小平0:04 | ||
| 東急目黒線 | 武蔵小杉 | 22:19 | 日暮里(山手線)23:44→目黒0:21 | この後奥沢行きがあります。 | |
| 東急池上線 | 蒲田 | 22:19 | 日暮里(山手線)23:38→五反田0:18 | この後雪が谷大塚行きがあります。 | |
| 京浜急行線 | 三崎口(特急)(平日) | 21:18 | 品川22:50 | ||
| 京浜急行線 | 三崎口(特急)(休日) | 21:18 | 品川22:48 | ||
| 京浜急行線 | 浦賀(平日) | 21:44 | 上野(山手線)23:07(京浜東北線)23:08→品川23:32(特急京急久里浜行き)→堀ノ内0:37 | ||
| 京浜急行線 | 浦賀(特急)(休日) | 21:44 | 上野(山手線)23:07(京浜東北線)23:08→品川23:33(特急京急久里浜行き)→堀ノ内0:35 | ||
| 京浜急行線 | 京急久里浜(特急)(平日) | 21:44 | 上野(山手線)23:07(京浜東北線)23:08→品川23:32 | ||
| 京浜急行線 | 京急久里浜(特急)(休日) | 21:44 | 上野(山手線)23:07(京浜東北線)23:08→品川23:33 | ||
| 京浜急行線 | 逗子・葉山(特急)(平日) | 22:04 | 上野(山手線)23:21(京浜東北線)23:20→品川23:45 | ||
| 京浜急行線 | 逗子・葉山(急行)(休日) | 21:18 | 品川23:23 | ||
| 京浜急行線 | 金沢文庫(特急)(平日) | 22:19 | 上野(山手線)23:37(京浜東北線)23:32→品川0:02 | ||
| 京浜急行線 | 金沢文庫(特急)(休日) | 21:44 | 上野(山手線)23:31(京浜東北線)23:32→品川0:00 | ||
| 京浜急行線 | 神奈川新町(特急)(平日) | 22:43 | 上野(山手線)23:26(京浜東北線)23:26→品川23:53 | 普通神奈川新町行き23:47 | |
| 京浜急行線 | 神奈川新町(普通)(休日) | 22:43 | 上野(山手線)23:21(京浜東北線)23:26→品川23:49 | 特急神奈川新町行き23:45 | |
| 京浜急行線 | 小島新田(京急川崎乗換)(平日) | 22:19 | 上野(山手線)23:37(京浜東北線)23:32→品川0:02(特急金沢文庫行き)→京急川崎0:17 | ||
| 京浜急行線 | 小島新田(京急川崎乗換)(休日) | 21:44 | 上野(山手線)23:07(京浜東北線)23:08→品川23:32(特急京急久里浜行き)→京急川崎23:48 | ||
| 京浜急行線 | 羽田空港(急行)(平日) | 22:19 | 上野(山手線)23:31(京浜東北線)23:32→品川23:59 | ||
| 京浜急行線 | 羽田空港(急行)(休日) | 22:19 | 上野(京浜東北線)23:32→品川23:42 | 必ず京浜東北線を利用して下さい。(山手線利用不可) |