NEW CHARACTERで名前と年齢を入力してスタートすると、マザーシップオンディーナに降り立つことになる。 最初、愛機ブラスティーは何も装備していないため、所持金でエンジンと燃料を買わないと、いきなりゲームを進めることができなくなるので要注意だ。 他にも、経験値をストックするコンピューターユニットを買っておかないと、いくら敵を倒しても経験値を蓄積できないゾ。 武器については、序盤は唯一標準で装備されているバルカン砲でも十分に戦えるので、とりあえず出撃だ。
最初はオンディーナ周辺宙域を徘徊して、AGRESSを倒しまくって経験値＆資金稼ぎだ。

序盤は、とにかく経験値と資金稼ぎをせっせとしよう。 そして、敵を倒してゲットした賞金をオンディーナのラボラトリーに投資して新兵器を開発してもらい、 ブラスティーの装備を強化して今後の戦いに備えるのだ。
ある程度レベルを上げて装備も充実したら、いよいよオンディーナを離れて宇宙空間を本格的に探索だ。

階差閉宇宙の言葉から分かるとおり、ブラスティーの世界は階層化されている宇宙であり、ダンジョン同様の構造となっているため、 マッピングの要領も同じだ。
宇宙には、ダンジョンの壁に相当する反物質の壁があるため、それらをチェックしつつ、次の階層への入り口を探すことがメインとなるゾ。 場所によっては、ヒントのようなメッセージが残されているところもあるので、聞いておくと後々のストーリー展開の布石となるハズだ。
また、オンディーナのバーでも情報収集ができるので、先の階層へ進む前に忘れずにチェックだ。

階層２へ進撃すると、新たな敵BAGRESSが出現するが、AGRESSとたいして強さは変わらないので、 とりあえず探索に専念だ。
この階層では、中立サイドステーションバル・バウスがあり、修理と補給のみ可能となっているので、 ここを早期に発見してベース基地としたい。

この階層では、コミューンとインバースの双方の情報がいろいろと入手できる。 また、中立サイドステーションフィール・ウォークスの他、 オンディーナと同様のコミューン側サイドリヒトホーンも存在するので、 ここまでで得た賞金でより強力な武器を手に入れるといいだろう。
なお、この階層での新たなる敵はBUBRAYだ。

そろそろ武装も強化されてきたころだが、そうなるとやはりエネルギー消耗度合いも著しくなって、補給に気を遣わなければならなくなる。 「PARTICLE」を使用して敵との遭遇率を下げたりするのも有効だが、 やはりFIGHTER形態で使用できる武器を搭載してGUNNER形態に変形しないで戦闘を早期に決着させるのがベストなので、 ラボラトリーにガンガン投資して、FIGHTER用の武器を購入だ。威力も高いので、ザコキャラなら一撃で撃破できるゾ。
この階層では中立サイドステーションタルカスを拠点に攻略だ。 最終階層へのゲートの他、階層３への一方通行ゲートもあるので、攻略中にエネルギーが少なくなったら使用すると良いだろう。
なお、この階層での新たなる敵はCRUBRAYだ。

階層５へのゲートの先には３つのゲートがあり、１つだけが階層５の本区画へ繋がっている。
ここでは、CLASTERが新たに出現するが、もはや敵では無いはずだ。
階層５の本区画では、磁場に阻まれた区画の他に、伝説のステーションリベリオンに通じる区画がある。 ここでは、インバースから共にコミューンを倒すべく誘いを受けることになり、プレイ中最大の選択に迫られることになるゾ。