「ぷよぷよフィーバー」はいろいろなゲームモードがあます。
一人で遊ぶ・友達とわいわい・ネット対戦と多彩な遊び方ができます。
ただし、旧Win版ぷよぷよフィーバーはネット対戦環境のver2.0移行となってからはネット対戦（オンライン）機能でのプレイはできません。
ネット対戦環境については、第3章：ゲームモード（ぷよフィ）→「ネット接続環境（Winぷよフィ）」を参照ください。
表1は、各ゲームモードの概要です。
表2は、各ゲームモードの対戦ルールです。
| はじめに | ぷよぷよフィーバーの紹介です。 | ||
|---|---|---|---|
| オフラインゲーム | ネット対戦をしないモードです。「ひとりでぷよぷよ」「ふたりでぷよぷよ」「とことんぷよぷよ」「オプション」を選択できます。 | ||
| ひとりでぷよぷよ | COM相手に対戦するモードです。「るんるんコース」「わくわくコース」「はらはらコース」「フリー対戦」が選択できます。 | ||
| るんるんコース | アミティを使用します。対戦キャラクターは3。ストーリーを進むごとに、強い敵が出現します。 | ||
| わくわくコース | アミティを使用します。対戦キャラクターは8。ストーリーを進むごとに、強い敵が出現します。 | ||
| はらはらコース | ラフィーナを使用します。対戦キャラクターは8（※1）。ストーリーを進むごとに、強い敵が出現します。 | ||
| フリー対戦 | 自キャラ・対戦キャラクターを指定して対戦します。 | ||
| ふたりでぷよぷよ | 対人対戦を直接するモードです。「ふつうのルール」「クラシックルール」「トラップルール」「エディットルール」が選択できます。 | ||
| ふつうのルール | フィーバールールで対戦します。 | ||
| クラシックルール | クラシックルール（ぷよぷよ通ベース）で対戦します。 | ||
| トラップルール | フィーバールールで対戦しますが、フィーバーモードでの攻撃力が非常に低くなっています。 | ||
| エディットルール | 対戦ルールをエディットして対戦することができます。 | ||
| とことんぷよぷよ | 対戦相手のないシングルプレイのモードです。「フィーバー」「タスク」「オリジナル」が選択できます。 | ||
| フィーバー | 連鎖のタネを時間内に消し続けるモードです。 | ||
| タスク | 次々出てくる問題を時間内にクリアし続けるモードです。 | ||
| オリジナル | 元祖というべきとことんぷよぷよです。ひたすらぷよを消していくモードです。 | ||
| オプション | 「難易度」「まんざいデモ」「れんさアニメ」「ギャラリー」「リプレイ」「セーブ/ロードの確認や設定を行なうモードです。 | ||
| オンラインゲーム | ネット対戦をすることのできるモード（※2）です。「ひとりでぷよぷよ」「ふたりでぷよぷよ」「とことんぷよぷよ」「オプション」を選択できます。 | ||
| ひとりでぷよぷよ | COM相手に対戦するモードです。「るんるんコース」「わくわくコース」「はらはらコース」「フリー対戦」が選択できます。 | ||
| るんるんコース | アミティを使用します。対戦キャラクターは3。ストーリーを進むごとに、強い敵が出現します。 | ||
| わくわくコース | アミティを使用します。対戦キャラクターは8。ストーリーを進むごとに、強い敵が出現します。 | ||
| はらはらコース | ラフィーナを使用します。対戦キャラクターは8（※1）。ストーリーを進むごとに、強い敵が出現します。 | ||
| フリー対戦 | 自キャラ・対戦キャラクターを指定して対戦します。 | ||
| とことんぷよぷよ | 対戦相手のないシングルプレイのモードです。「フィーバー」「タスク」「オリジナル」が選択できます。 | ||
| フィーバー | 連鎖のタネを時間内に消し続けるモードです。 | ||
| タスク | 次々出てくる問題を時間内にクリアし続けるモードです。 | ||
| オリジナル | 元祖というべきとことんぷよぷよです。ひたすらぷよを消していくモードです。 | ||
| ロビーに接続 | ネット対戦を行なうため、ロビーに接続するモード（※2）です。「入室」「退室」「たいせん」「ログアウト」「最新情報へ」が選択できます。 | ||
| 入室 | 初級、中級、上級、エキスパート、待ち合わせを選択して入室します。 | ||
| 退室 | 選択した部屋から退室します。 | ||
| たいせん | 対戦相手を選択できます。 | ||
| ログアウト | ロビーからログアウトします。 | ||
| 最新情報へ | セガのサイトへ接続（※3）します。 | ||
| コンフィグ設定 | PC環境の設定を行なうモードです。「キーアサイン」「ショートカット」「Network」「システム」「ニックネーム変更」が選択できます。 | ||
| キーアサイン | Player1、Player2のキーアサイン（キーボード、パッド、OFF（Player2のみ））を行ないます。 | ||
| ショートカット | F1〜F7（※4）までのショートカットメッセージの設定。 | ||
| Network | リプレイデータ自動保存、ゲーム内チャット表示行数、回線切断表示、ハンドル名記録に関する設定を行ないます。 | ||
| システム | 画質、BGM・SE再生、起動モード（画面）、表示方式に関する設定を行ないます。 | ||
| ニックネーム変更 | ニックネーム（全角8文字/半角16文字まで）の変更を行ないます。 | ||
| 最新版へアップデート | 最新バージョンへのアップデート（※2）を行ないます。一度でもアップデートを行なうと、この項目が追加されます。 | ||
| 対戦相手 対人／対COM |
対戦人数 | 勝利確定条件 | 対戦ルール | ネット対戦 | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| ひとりで ぷよぷよ |
るんるん コース |
対COM | 1対1 | 3回戦勝利 | ぷよぷよ フィーバー |
オンライン の場合 乱入あり |
| わくわく コース |
8回戦勝利 | |||||
| はらはら コース |
||||||
| フリー対戦 | 1勝先取 | |||||
| 乱入 されたよ |
対人 | あり | ||||
| ふたりで ぷよぷよ |
ふつうの ルール |
対人 | 1対1 | 1勝先取 | ぷよぷよ フィーバー |
なし |
| クラシック ルール |
ぷよぷよ フィーバー |
|||||
| トラップルール | ぷよぷよ フィーバー |
|||||
| エディットルール | ぷよぷよ フィーバー |
|||||
| とことん ぷよぷよ |
フィーバー | シングルプレイ | 敗北まで | フィーバー | オンライン の場合 乱入あり |
|
| タスク | タスク | |||||
| オリジナル | オリジナル | |||||
| ロビーに 接続 |
たいせん | 対人 | 1対1 | 1勝先取 | ぷよぷよ フィーバー |
あり |