「ストーリー」は「ぷよぷよ！」の中心的なモードで、ストーリーにそってCOM対戦するモードです。
利用するキャラを選択して8回戦のCOM対戦を勝ち抜きます。
時間はかかりますが、全22キャラで「S」ランク取得できるようにがんばりましょう。
表1は、ゲームモードの概要です。
表2は、ゲームモードの対戦ルールです。
表3は、ゲームモードの流れです。
表4は、中断時のメッセージです。
なお、各対戦ルールについては、第3章：ゲームモード（ぷよ！）の「DS版ぷよぷよ！ ： 対戦ルール」の「対戦ルール（DS版ぷよ！）」、「DS版ぷよぷよ！ ： 各対戦ルール解説」以下の各ページを参照ください。
「なんいど」変更による違いは第3章：ゲームモード（ぷよ！）→「せってい（DS版ぷよ！）」を参照ください。
| ひとりでぷよぷよ | 「ストーリー」「じゅぎょう」「とことん」「フリーたいせん」などの一人で遊ぶモードを選択できます。 | |
|---|---|---|
| ストーリー | 各キャラ毎のストーリーを楽しむモードです。 | |
| 対戦相手 対人／対COM |
対戦人数 | 勝利確定条件 | 対戦ルール | 無線利用 | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ひとりで ぷよぷよ |
ストーリー | 対COM | 1対1 | 8回戦勝利 | 対戦ルールすべて （12種類） |
なし | |
| ① | オープニング後の画面から「ひとりでぷよぷよ」を選択。 |
|---|---|
| ② | 「ストーリー」を選択。 |
| ③ | 利用するキャラクターを選択。 |
| ④ | 対戦相手とのまんざいデモ（スタートボタンでスキップ）。 |
| ⑤ | ストーリールーレットで対戦ルールを選択。 |
| ⑥ | 相手キャラとの対戦。 |
| ⑦ | 勝利すると、ランク判定。 |
| ⑧ | 8回戦勝利まで④～⑦の繰り返し。 |
| ⑨ | 優勝デモ。 |
| ⑩ | エンディング・スタッフロール。 |
| ⑪ | 全8回戦の成績表示、総合ランク判定。 |
| ⑫ | メダルゲット。場合により隠し要素の出現。 |
対戦相手は、③の利用するキャラ毎に異なります。
ストーリールーレットは、対戦相手のキャラ毎に異なります。
詳細は、第2章：キャラクター（ぷよ！）→「対戦キャラ、ストーリールーレット（DS版ぷよ！）」を参照ください。
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