「ぷよぷよ！」はいろいろなゲームモードがあます。
一人で遊ぶ・友達とわいわい・Wi-Fiでネット対戦と多彩な遊び方ができます。さらに「じゅぎょう」で初心者をフォローと過去のどのシリーズよりも広がりのある作品となっています。
表1は、各ゲームモードの概要です。
表2は、各ゲームモードの対戦ルールです。
表3は、隠し要素の出現条件です。「ぷよぷよ！15th anniversary@2ch Wiki」（第0章：はじめに（共通）→外部リンクを参照）から一部情報を引用。
| ひとりでぷよぷよ | 「ストーリー」「じゅぎょう」「とことん」「フリーたいせん」などの一人で遊ぶモードを選択できます。 | ||
|---|---|---|---|
| ストーリー | 各キャラ毎のストーリーを楽しむモードです。 | ||
| じゅぎょう | お手本にそって連鎖の組み方を学んだり、ドリルを解いたりするレッスンモードです。 | ||
| 初級コース | 階段積みの組み方を学ぶレッスンモードです。 | ||
| 中級コース | 挟み込みの組み方を学ぶレッスンモードです。 | ||
| 上級コース | 折り返しの組み方を学ぶレッスンモードです。 | ||
| とことん | 「とことんたいせん」「とことんぷよぷよ」「とことんフィーバー」「とことんなぞぷよ」などのモードを選択できます。 | ||
| とことんたいせん | 次々現れるキャラ（COM）相手に対戦するモードです。 | ||
| とことんぷよぷよ | 元祖というべきとことんぷよぷよです。ひたすらぷよを消していくモードです。 | ||
| とことんフィーバー | 連鎖のタネを時間内に消し続けるモードです。 | ||
| とことんなぞぷよ | 次々出てくる問題を時間内にクリアし続けるモードです。 | ||
| フリーたいせん | 対戦ルール・自キャラ・相手キャラ（COM）を選んで対戦するモードです。 | ||
| ふたりでぷよぷよ | プレイヤーとCOM1で対戦するモードです。 | ||
| みんなでぷよぷよ | プレイヤーとCOM1〜3で対戦するモードです。 | ||
| もっとみんなでぷよぷよ | プレイヤーとCOM1〜7で対戦するモードです。 | ||
| みんなでぷよぷよ | 「ぼしゅう」「さんか」などのDSワイヤレス通信を利用して遊ぶモードを選択できます。 | ||
| ぼしゅう | 新しく部屋を開き、対戦希望者を募集するモードです。 | ||
| ふたりでぷよぷよ | 2人で対戦するモードです。 | ||
| みんなでぷよぷよ | 2〜4人（COM含む）以下で対戦するモードです。 | ||
| もっとみんなでぷよぷよ | 2〜8人（COM含む）以下で対戦するモードです。 | ||
| さんか | 開いている部屋に入り、対戦に参加するモードです。 | ||
| Wi-Fi | 「Wi-Fiぷよぷよ」「ともだち設定」「Wi-Fi設定」などのニンテンドーWi-Fiコネクションを利用して遊ぶモードを選択できます。 | ||
| Wi-Fiぷよぷよ | Wi-Fiコネクションに接続して、ネット対戦するモードです。 | ||
| だれかとぷよぷよ | 全国の誰かと対戦することができるモードです。「2人でフィーバー」「2人でぷよ通」「4人でフィーバー」「4人でぷよ通」の4つの中から遊ぶゲームを選びます。 | ||
| ともだち募集 | 「ともだちリスト」に登録した相手と対戦するモードです。「ぷよぷよフィーバー」「ぷよぷよ通」「ぷよぷよ」の3つの中から遊ぶゲームを選びます。 | ||
| ともだち参加 | 「ともだちリスト」に登録した相手と対戦します。友達が募集しているゲームに参加します。 | ||
| ともだち設定 | 「ともだちリスト」「コードの登録」「コードの確認」などのともだちに関しての設定を行うモードです。 | ||
| ともだちリスト | 最大64人まで「ともだちコード」を確認できます。 | ||
| コードの登録 | 「ともだちコード」を登録できます。 | ||
| コードの確認 | 自分の「ともだちコード」を確認できます。 | ||
| Wi-Fi設定 | ネットへの接続方法など、Wi-Fiコネクションに関する設定をするモードです。 | ||
| せいせき | 「ストーリー」「みんなでぷよぷよ」「Wi-Fi」「とことんたいせん」「とことんぷよぷよ」「とことんフィーバー」「とことんなぞぷよ」での成績を確認できます。 | ||
| ストーリー | 「ストーリー」での各キャラのランクが確認できます。 | ||
| みんなでぷよぷよ | DSワイヤレス通信の対戦成績が確認できます。 | ||
| Wi-Fi | Wi-Fiコネクションのレーティング・段位・対戦成績が確認できます。 | ||
| とことんたいせん | とことんたいせん（ぷよぷよ・ぷよぷよ通・ぷよぷよフィーバー）の最高得点の得点・勝抜き回数・プレイ時間・最大連鎖数を確認できます。 | ||
| とことんぷよぷよ | とことんぷよぷよ（激甘、中辛、激辛）の最高得点の得点・レベル・プレイ時間・ぷよを消した数を確認できます。 | ||
| とことんフィーバー | とことんフィーバー（激甘、中辛、激辛）の最高得点の得点・レベル・プレイ時間・タネ消化数を確認できます。 | ||
| とことんなぞぷよ | とことんなぞぷよ（激甘、中辛、激辛）の最高得点の得点・レベル・プレイ時間・クリア問題数を確認できます。 | ||
| おぷしょん | 「せってい」「かんしょう」などゲーム設定変更・サウンド等の鑑賞ができるモードを選択できます。 | ||
| せってい | ゲーム全体の設定を変更できます。 | ||
| かんしょう | サウンドやまんざいデモが鑑賞可能です。 | ||
| 対戦相手 対人／対COM |
対戦人数 | 勝利確定条件 | 対戦ルール | 無線利用 | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ひとりで ぷよぷよ |
ストーリー | 対COM | 1対1 | 8回戦勝利 | 対戦ルールすべて （12種類） |
なし | |
| じゅぎょう | 初級コース | シングルプレイ | なし | ||||
| 中級コース | |||||||
| 上級コース | |||||||
| とことん | とことん たいせん |
対COM | 1対1 | 敗北まで | 「ぷよぷよ」 「ぷよぷよ通」 「ぷよぷよフィーバー」 |
なし | |
| とことん ぷよぷよ |
シングルプレイ | 敗北まで | とことんぷよぷよ | ||||
| とことん フィーバー |
とことんフィーバー | ||||||
| とことん なぞぷよ |
とことんなぞぷよ | ||||||
| フリー たいせん |
ふたりで ぷよぷよ |
対COM | 1対1 | 2勝先取 | 対戦ルールすべて （12種類） |
なし | |
| みんなで ぷよぷよ |
2〜4 | ||||||
| もっとみんなで ぷよぷよ |
2〜8 | 「ぷよぷよ」 「ぷよぷよ通」 「ぷよぷよフィーバー」 |
|||||
| みんなで ぷよぷよ |
ぼしゅう | ふたりで ぷよぷよ |
対人 （＋対COM） |
1対1 | 2勝先取 | 対戦ルールすべて （12種類） |
DSワイヤレス通信 |
| みんなで ぷよぷよ |
2〜4 | ||||||
| もっとみんなで ぷよぷよ |
2〜8 | 「ぷよぷよ」 「ぷよぷよ通」 「ぷよぷよフィーバー」 |
|||||
| さんか | 「ぼしゅう」 条件による |
「ぼしゅう」 条件による |
|||||
| Wi-Fi | Wi-Fi ぷよぷよ |
だれかと ぷよぷよ |
対人 | 2or4 | 2勝先取 | 「ぷよぷよ通」 「ぷよぷよフィーバー」 |
Wi-Fiコネクション |
| ともだち募集 | 2〜4 | 「ぷよぷよ」 「ぷよぷよ通」 「ぷよぷよフィーバー」 |
|||||
| ともだち参加 | |||||||
| キャラ | サタン | 「ストーリー」で対戦キャラとして登場して、クリアする。 |
|---|---|---|
| シェゾ | ||
| すけとうだら | ||
| ぞう大魔王 | ||
| ナスグレイブ | ||
| ルルー | ||
| 対戦ルール | はっくつ | 「ストーリー」でその対戦ルールで戦い（ストーリールーレットで選択）、クリアする。 |
| ばくだん | ||
| だいかいてん | ||
| サーチライト | ||
| ずっとフィーバー | ||
| すいちゅう | ||
| こおりづけ | ||
| なぞぷよ | ||
| でかぷよ | ||
| ぷよの絵柄 | キューブ（8pも） | 「とことんたいせん」(ぷよぷよ）で8人抜きする |
| ヒューマン（8pも） | 「とことんたいせん」(ぷよぷよ通）で8人抜きする | |
| カプセル（8pも） | 「とことんたいせん」(ぷよぷよフィーバー）で8人抜きする | |
| ボード | 「とことんなぞぷよ」スコア242415点をこえる | |
| ボックス（8pも） | 「とことんフィーバー」スコア2424150点をこえる | |
| テープ | 「とことんぷよぷよ」スコア242415点をこえる | |
| チョーク | 「じゅぎょう」でドリル300問をクリアする | |
| MSX | 「ストーリー」でS評価12個ゲットする | |
| モロせいじん | 「ストーリー」でS評価16個ゲットする | |
| ソニック | 「ストーリー」でS評価22個ゲットする | |
| スミ | 「ストーリー」で初代キャラ（ナスグレイブ・すけとうだら・ぞう大魔王・シェゾ・ルルー・サタン）S評価6個ゲットする | |
| ビーン（8pのみ） | 「ストーリー」でS評価2個ゲットする | |
| スター（8pのみ） | 「ストーリー」でS評価4個ゲットする | |
| タイル（8pのみ） | 「ストーリー」でS評価6個ゲットする | |
| ブロック（8pのみ） | 「ストーリー」でS評価8個ゲットする |
裏技によって、隠し要素を全て出現させることが可能です。
出現方法は、第0章：はじめに（ぷよぷよ！）→「裏技、バグ（DS版ぷよ！）」を参照ください。