ロウルート

・キャラクターの名前入力画面でデフォルトのままにしておく
・新岡本ジムでヒロコの頼みをきく
・コロシアムでダレスにとどめを刺さない
・妖精エリアでパックから浮気草の露を買う
・ホーリータウンの教会再建に寄付する
・ファクトリーでペテルセンの頼みを聞く
・ファクトリー収容者をたすける
・ギメルを倒した後、自分がアルカディアの救世主になる
・ゲーム終盤のサタンの誘いに応じる

カオスルート

・新岡本ジムでヒロコの頼みを断る
・コロシアムでダレスにとどめを刺す
・妖精エリアでパックから浮気草の露とマッカを奪う
・ファクトリーでペテルセンの頼みを断る
・ギメルを倒した後、ＣＯＭＰを破壊する
・ゲーム終盤のサタンの誘いを断り、ルイ・サイファーの誘いに応じる

ニュートラルルート

ゲーム終盤のサタンとルイ・サイファーの誘いを両方とも断る。そのあと壁の顔にいろいろ質問されるところで、最後に「なににも頼らぬ」と言われればニュートラル。しかしこのあとも属性が動くので、仲魔や戦い方に注意。

将門公合体

首	ホーリータウンの大教会3Fにいるストーカーが持ってる
胴	コトシロヌシのほこら。コトシロヌシの石化を解かないといけないので、あらかじめディストーンを準備しよう
右腕	旧赤坂西/オオナムチのほこらでバフォメットを倒すともらえる
左腕	旧六本木西/サルタヒコのほこらでサルタヒコを正気に戻すともらえる
右脚	旧赤坂東/オオヤマツミのほこらで迷子になってるオオヤマツミを助けるともらえる
左脚	旧六本木東/スクナヒコナのほこらでスクナヒコナを助けるともらえる（助けるのはかなり面倒ですがしょうがない）

ピラーを集めよう

太陽のピラー	将門公を復活させると、お礼にくれる
月のピラー	復興したホーリータウンのディスコのレイブパーティーで優勝するとくれる
火星のピラー	ヴァルハラ〜センター間の通路でダレスと戦い、勝と彼が落としていく
水星のピラー	復興したホーリータウンのジャンク屋のオヤジがくれる
木星のピラー	セイレーンの歌を止めた後、ファクトリーのベテルギウスがいた場所で労働者がくれる
金星のピラー	モロクの尻尾出現後、ミュータントの長老がくれる
土星のピラー	地下世界北部の発掘場所で地霊の手伝いをすると貰える