ScatterMaker 6

概要

表のデータに基づきその分布を確認するソフトウェア。

上記3タイプのグラフでデータを視覚的に確認できる。

群間比較を行う散布図においては、ドットの重なりを自在に調整することができる。全く重なりのない分布を直感的に把握できるグラフを自動的に作成することができる。

箱ひげ図は中央値,四分位点で箱が形成され,最小値最大値はバーで示される。第1四分位点と第3四分位点の差をinterquartile range (IQR)とした時,第一四分位点を1.5IQR以上下回った値,第3四分位点を1.5IQR以上上回った値は外れ値として表示される。

記述的統計の出力のほか、簡単な統計検定を行い、客観的に評価することが可能。

一つのファイルに一つの表と複数のグラフを設定できるファイル構造を採用する。

表の作成

上記4つの方法で作成できる。

表の編集

表の出力

いずれもタブ区切りテキストとして出力される。

グラフ

グラフの作成

  1. 表を変数選択モードに切り替える。
  2. 変数を選択する。
    • (群間比較のための散布図・箱ひげ図)1つ以上の数値変数を選択する必要がある。
    • (データの相関をみる散布図)数値変数は2つ選択する必要がある。x・y軸の入れ替えは作成後可能。
    • グループ分けするための変数の設定は任意である。

    Summary Table

  3. グラフの種類を指定する。
  4. グラフが作成される。

グラフの設定変更

主要なパーツの用語の定義は以下の通り

GraphColumnGap

Graph Categories

Graph Details

グラフの出力

注意が必要な設定

グラフの大きさ

プロットエリアの大きさを指定,ないしは自動計算ののち目盛りやタイトル,凡例などを設定に応じて表示し,全体の大きさは自動的に決定される。全体の大きさを最初に指定することは仕様上できない。

プロットエリアの幅

データの相関をみる散布図の場合はグラフの幅を直接指定する。群間比較のための散布図・箱ひげ図の場合は一つの群の幅を定義し,カテゴリ分けのレベル毎にギャップを指定する。グラフの幅はその和で決定される。最初にプロットエリアの幅を指定することは仕様上できない。

ドットの大きさの設定

ドットの形によって面積が異なると分布が異なるように見えるリスクがあるため,面積が等しくなるような仕様とした。

おおよその幅を指定する。各ドットの面積が等しくなるようしているため,ドットの形によって実際の幅はわずかに異なる。

軸の最小最大値,目盛りの設定

全体のドットの最小値を上回る最小値は設定できない。全体ドットの最大値を下回る最大値は設定できない。

目盛りは数字を入力したら自動的に位置も決定される。

累乗などに対応するため,texのequation形式の表現に部分的に対応している。例えば分数は自動的にインライン変換するなど,texを完全に再現しているわけではない。

例えば,0.0015は「1.5\times10^{-3}」と設定することができる。

Graph Scales

軸のタイトル

tex様の表記を採用している。「$」で囲んだ領域は上記の目盛りと同様の表記となる。

Graph Y Title

記述統計量と群間比較検定

分散,標準偏差,歪度,尖度

デフォルトでは,"Use unbiased estimators..."がチェックされ,不偏推定量が表示される。母集団からの無作為抽出のデータの場合は不偏推定量を用いるべきである。つまりはほとんどの場合は不偏推定量でよいと思われる。

注意:標準偏差に関しては厳密には不偏推定量を使っていない。使用するアプリケーションによる値の違いで混乱しないようにするため,多くの表計算,統計ソフトが使用している分散の不偏推定量の平方根を使用している。

正規性の検定

Shapiro-Wilk検定1)かKolmogorov-Smirnov検定2)の結果を表示する。Shapiro-Wilk検定の方が検出力が高いとされていること3),Kolmogorov-Smirnov検定のLillieforsの修正を実装しておらず,サンプルサイズが小さい場合は特にKolmogorov-Smirnov検定の検出力が低いことから3),Shapiro-Wilk検定を優先的に表示する。使用している近似計算の都合によりサンプルサイズ5,000を超える場合はShapiro-Wilk検定が計算できないためKolmogorov-Smirnov検定の結果を出力する。

正規性の検定はあくまで参考のために表示している。その他の検定結果同様作者はこの結果の精度に責任は負えない。自己責任で結果を参照すること。使用している近似計算のアルゴリズムは以下の通り。

1) Royston P: Approximating the Shapiro-Wilk W-test for non-normality. Statistics and Computing 1992: 2, 117-119.

2) Simard R, L'Ecuyer P: Computing the Two-Sided Kolmogorov-Smirnov Distribution. Journal of Statistical Software 2011: 39, 11.

3) Razali MN: Power comparisons of Shapiro-Wilk, Kolmogorov-Smirnov, Lilliefors and Anderson-Darling tests. Journal of Statistical Modeling and Analytics 2011: 2, 21-33.

旧バージョンとの互換性

Kuroの部屋