「ゴーストパズル」は、元はiOS版「ゴーストトリック」のクリア後のおまけで、本作にも収録されています。
iOS版では、パズルに正解するとiOS用壁紙がダウンロードできる仕様になっていました。
本作では、パズルに正解することで、「イラストアツメ」に18種類のイラストが追加されます。
内容は一般にスライドパズル、8パズル、15パズル（15パズル - Wikipedia）などと呼ばれるものです。ただし「ゴーストパズル」の場合は絵柄が常に動いています。
解き方は「15パズルの解き方」などで検索するとたくさん出てきます。また、当ページの一番下にも解き方を載せてありますので、困ったらご利用ください。
ゴーストパズルは開始時に毎回ランダムでピースの位置が決定されるため、「絶対にこれ」という手順はありません。
パズルを解く際は、時間制限などはありませんので、地道に解いてみましょう。
「ヒント」を押すと、番号が表示されます（初期位置が解る）。
ヒントを見ることによるペナルティはありません。チャレンジ「トカズニハイラレナイ」の取得にも影響しません。
iOS版とは異なり、一度押せば番号は表示されたままなので、難易度が少し下がっています。
スライドパズルに自信がないのなら、番号を表示させたままのプレイをおすすめします。
なお、パーツをスライドする際は、直線上ならまとめて移動させることが可能です。
絵柄は以下の3種類で、それぞれ3×3マス、4×4マス、5×5マスのパズルが選択できます。
それぞれに対応した「イラストアツメ」用イラストが2種類ずつあり、最終的に「イラストアツメ」に18種のイラストが追加されるようになっています。
5×5マスの3種類すべて解くとチャレンジ「トカズニハイラレナイ」が取得できます。
リンネの部屋
3×3：カノンとミサイル、舞うマダム
4×4：ジーゴとテンゴ、シセル（フィルム・白背景）
5×5：シセル（シルエット）、ミサイル×23
看守室
3×3：テンテコの舞、公園を守る男
4×4：メメリとコック、シセル（ジャケット絵）
5×5：リンネ（シルエット）、みんなでテンテコの舞（敵キャラver.）
道路
3×3：リンネ、シセル（フィルム・黒背景）
4×4：ミサイル、Me.
5×5：みんなでテンテコの舞（味方キャラver.）、グラサン4人組
解き方は色々ありますが、比較的わかりやすいのは、上の横一列を揃える、左の縦一列を揃える、上から二番目の横一列を揃える、左から二番目の縦一列を揃える……という方法です。
ここでは4×4マスのパズルで説明しますが、3×3でも、5×5でも考え方は同じです。
絵柄だけだとわかりにくいので、一般的な、
①②③④
⑤⑥⑦⑧
⑨⑩⑪⑫
⑬⑭⑮□
という数字のパズルとしておきます（ゴーストパズルでもヒントとして数字を表示する機能があります）。
上の状態が正解として、以下のようにシャッフルされたとします。
②⑤⑦⑫
⑧⑬⑥⑨
④①⑮⑭
⑪③⑩□
まず上の横一列（②⑤⑦⑫になっているところ）を「①②③④」にします。
①を一番左上へどうやって持っていくか？ ですが、まずわかりやすいように空白マス「□」を移動します。
⑮⑭⑩をぐるぐる回すだけです。
下図のように黄色背景の部分を1つずつずらして回します。
②⑤⑦⑫
⑧⑬⑥⑨
④①□⑩
⑪③⑭⑮
そうしたら、今度は下図のピンク色背景部分に注目してみてください。
②⑤⑦⑫
⑧⑬⑥⑨
④①□⑩
⑪③⑭⑮
ピンク色背景の部分に空白マスと①が含まれているのがポイントです。
このピンク色背景部分には空白が含まれているので、ピンク色背景に沿ってぐるぐるとピースを回していくことができます。
ピースをずらしていくと、いずれ①が左上マスにたどり着きます。
①④⑧⑫
□⑬②⑨
⑥⑦⑤⑩
⑪③⑭⑮
これで①は左上に戻りましたので、もう動かさないようにします。
このように“空白マス”と“移動したい場所”と“移動したいピース”を「ぐるぐる回す」のがポイントです。
この「ぐるぐる回す」やり方さえ掴めば、どんな配置であろうと、移動したいピースを希望の場所へ移動させることができます。
次に②を①の右へ持っていきたい場合は、
①④⑧⑫
□⑬②⑨
⑥⑦⑤⑩
⑪③⑭⑮
青色背景マスをちょっとくねりながら回せばOK。
①②⑤⑫
④⑧⑦⑨
⑬□⑥⑩
⑪③⑭⑮
次に③を移動させたいところですが、同時に④も回して一緒に右上に③④を揃えてしまいます。
④だけ後で入れるのは二度手間になるためです。
①②⑤⑫
④⑧⑦⑨
⑬□⑥⑩
⑪③⑭⑮
緑色背景マスで回して、③を④の真下に移動。
①②⑤⑫
④⑧⑦⑨
③⑪⑥⑩
□⑬⑭⑮
上のようになったら後は、下図のように、
①②⑤⑫
④⑧⑦⑨
③⑪⑥⑩
□⑬⑭⑮
水色背景マスで回していきます。
①②③④
⑭⑬□⑧
⑮⑪⑥⑦
⑩⑨⑫⑤
すると、左上にぴったり③④が並ぶことになります。
これで上一列が完成。もうこの列はいじらず、残りを同じ要領で入れ替えていきます。
ちなみに、このやり方はわかりやすいですが、最短の手順で完成させることは多分できません。
あくまでも初心者向けのわかりやすい解き方です。他の解き方など詳しくは検索してみてください。