本作では、クリアしたエピソードを再度プレイする時に、「章を選ぶ」で好きな場所からプレイができます。
（3DS版以外は、未プレイのエピソードでも章を選んでプレイ可能）
章と対応するパート（セーブ時に表示される「法廷【その1】」などの表示）の対応表を掲載しました。
リンク先は該当の攻略ページです。
| パート | 番号 | 章 |
|---|---|---|
| 法廷【その1】 | 01 | はじめから |
| 02 | 開廷 | |
| 法廷【その2】 | 03 | 休廷 |
| 04 | ジェゼール入廷 | |
| 法廷【その2】 | 05 | 寿沙都乱入 |
| 06 | 終幕 |
| パート | 番号 | 章 |
|---|---|---|
| 探偵【その1】 | 01 | はじめから |
| 02 | ホームズ登場 | |
| 03 | 共同推理 その1 | |
| 探偵【その2】 | 04 | 再び、調査 |
| 探偵【その3】 | 05 | 共同推理 その2 |
| 06 | 終幕 |
| パート | 番号 | 章 |
|---|---|---|
| 探偵【その1】 | 01 | はじめから |
| 法廷【その1】 | 02 | 開廷前・控室 |
| 03 | 開廷 | |
| 法廷【その2】 | 04 | 最終弁論 |
| 法廷【その3】 | 05 | 休廷・控室 |
| 06 | ジーナ登場 | |
| 07 | 終幕 |
| パート | 番号 | 章 |
|---|---|---|
| 探偵【その1】 | 01 | はじめから |
| 02 | 調査開始 | |
| 探偵【その2】 | 03 | 漱石の下宿へ |
| 04 | 共同推理 | |
| 法廷【その1】 | 05 | 開廷前・控室 |
| 06 | 開廷 | |
| 07 | オマーリ夫妻入廷 | |
| 法廷【その2】 | 08 | 最終弁論、再び |
| 09 | ガリデブ夫妻、証言台へ | |
| 10 | 終幕 | |
| 11 | ぼくたちの事務所 |
| パート | 番号 | 章 |
|---|---|---|
| 探偵【その1】 | 01 | はじめから |
| 02 | 成歩堂法律相談所の朝 | |
| 03 | 共同推理 | |
| 探偵【その2】 | 04 | 質屋をあとに |
| 05 | 事件発生！ | |
| 探偵【その3】 | 06 | 一夜明けて |
| 探偵【その4】 | 07 | 事件現場へ |
| 08 | 帰国前夜 | |
| 法廷【その1】 | 09 | 開廷前・控室 |
| 10 | 開廷 | |
| 法廷【その2】 | 11 | 事件当夜の証言 |
| 法廷【その3】 | 12 | 休廷・控室 |
| 13 | クログレイ召喚 | |
| 法廷【その4】 | 14 | 新たな証拠品 |
| 15 | 最後の尋問 | |
| 16 | 大団円 | |
| 17 | また会う日まで |